Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC8Q09428 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC8Q09428 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC8Q09428 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC8Q09428 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC8Q09428 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC8Q09428 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC8Q09428 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC8Q09428 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC8Q09428 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC8Q09428 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC8Q09428 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms