Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms