Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms