Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms