Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms