Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms