Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms