Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSBP1Q04837 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SSBP1Q04837 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSBP1Q04837 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SSBP1Q04837 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSBP1Q04837 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSBP1Q04837 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SSBP1Q04837 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SSBP1Q04837 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms