Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms