Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms