Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F1Q01094 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F1Q01094 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F1Q01094 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms