Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDM2Q00987 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms