Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms