Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms