Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms