Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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