Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms