Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPAP53621 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPAP53621 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms