Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDST1P52848 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDST1P52848 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDST1P52848 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms