Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAP1GDS1P52306 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms