Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms