Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLMP48507 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLMP48507 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLMP48507 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLMP48507 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLMP48507 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms