Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms