Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFI27P40305 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFI27P40305 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms