Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms