Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2E1P29083 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms