Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD38P28907 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD38P28907 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD38P28907 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD38P28907 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD38P28907 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD38P28907 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD38P28907 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD38P28907 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms