Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms