Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms