Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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PTPRBP23467 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PTPRBP23467 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PTPRBP23467 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PTPRBP23467 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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PTPRBP23467 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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