Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JAK1P23458 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JAK1P23458 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
JAK1P23458 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms