Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM1P18669 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms