Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms