Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB1P16220 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms