Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HPGDP15428 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HPGDP15428 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HPGDP15428 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HPGDP15428 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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