Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms