Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFAPP14136 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFAPP14136 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFAPP14136 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms