Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPIND1P05546 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERPIND1P05546 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERPIND1P05546 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms