Protein–RNA interactions for Protein: O95757

HSPA4L, Heat shock 70 kDa protein 4L, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4LO95757 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA4LO95757 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms