Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DTNBO60941 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTNBO60941 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTNBO60941 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms