Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NDUFS4O43181 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NDUFS4O43181 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NDUFS4O43181 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NDUFS4O43181 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NDUFS4O43181 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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