Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FANCAO15360 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCAO15360 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCAO15360 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms