Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBTB39O15060 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms