Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms