Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms