Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEMP2A6NFY4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms