Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms