Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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