Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms