Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms